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改进蛋白酶K(39450-01-6)法提取环境微生物样品总DNA(Zhu S)

2014-08-14 来源:亚科官网

 

所 需 试 剂: 0.15M NaCl 0.1M EDTA 1%  SDS 

NaAc (3M, pH 5.2) 
蛋白酶K溶液 20mg/ml (用无菌水配制) 溶菌酶溶液 50mg/ml (用无菌水配制) 液氮  
实验步骤:  
(1) 将适量环境样品(如土壤或污泥)装入1.5 ml Eppendorf管; (2) 加入1 ml 0.15M NaCl-0.1M EDTA; 
(3) 加入溶菌酶(sigma)至终浓度为2mg/ml并置于37℃水浴中温育1h; (4) 冻融三个循环(液氮3 min-65℃干热器3min); 
(5) 分别加入蛋白酶K溶液和SDS至终浓度为0.02和0.5%(wt / vol每一百ml 溶液中溶质克数),65℃温育1h; 
(6) 裂解液依次用等体积的酚、酚-氯仿-异戊醇(25:24:1)、氯仿抽提; (7) 加入1/4体积的NaAc (3M, pH 5.2)和2体积冷的纯乙醇沉淀核酸;-20℃放置1h; 
(8) 离心收集12000prm,10min,回收DNA沉淀; (9) DNA沉淀用70%乙醇和无水乙醇洗涤后风干; (10) 每管加入30-50ulTE(Tris-HCl缓冲液)回溶及电泳检测,-20℃保存。 
 
注:这种方法比较适合提取土壤环境微生物样品的总DNA。因为本法没有利用机械力量破碎细胞,因而所提取到的总DNA受机械剪切的程度较少,故用这种方法提出的DNA进行PCR扩增,其产物通常含有较少的嵌合体(chimera)。
 
苏州亚科科技股份有限公司编辑
 
 


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